Seit 2005 gehört Markus Rüdt zur Jugendabteilung des VfB Stuttgart. Nach seinem Studium begann er als Assistent der Jugendleitung und war Trainer der Mannschaften U14 bis U19. Seit 2007 gehört er als pädagogischer Leiter zur Jugendleitung. Seine Hauptaufgaben sind zum einen die Leitung der Jugendakademie und somit die Bildung,
Erziehung und Persönlichkeitsentwicklung der jungen Talente. Zum anderen zeichnet er für die Schulkooperationen des Vereins, die vor allem mit den drei Eliteschulen des Fußballs Johann-Friedrich-von-Cotta-Schule, Wirtemberg-Gymnasium und Linden-Realschule bestehen, verantwortlich. In diesem Zusammenhang trainiert er auch gemeinsam mit den hauptamtlichen Jugendtrainern die VfB-Talente drei Mal wöchentlich am Vormittag. Außerdem betreut Markus Rüdt die VfB-Auszubildenden zum Sport- und Fitnesskaufmann und steht allen Spielern in der Laufbahnberatung zur Verfügung.
